Esta Secretaría agrupa servicios y procesos afines relacionados a la coordinación de servicios de asistencia de salud de la población, incluyendo servicios de atención médica, certificados de eventos vitales y servicios para poblaciones vulneradas o desatendidas. En esta Secretaría, se integran las siguientes funciones:

1. Integrar y facilitar las prestaciones de servicios directos de salud a la población en general.
2. Desarrollar todas las políticas y programas necesarios para el mejoramiento de los servicios de salud en Puerto Rico.
3. Garantizar el cumplimiento de los objetivos clínicos, ofreciendo servicios de alta calidad.

Divisiones de la Secretaría Auxiliar

• División de Asistencia Médica (Medicaid)
• División del Registro Demográfico
• División de Alimentación Suplementaria para Madres y Niños (WIC)
• División de Servicios Médicos y Hospitalarios